Prevádzkovateľom Hlavnej železničnej stanice je Železničná spoločnosť Slovensko, a. s. (ZSSK), ktorá vznikla 1. januára 2005 rozdelením Železničnej spoločnosti, a. s. ako jedna z dvoch novozaložených nástupníckych akciových spoločností. Akékoľvek informácie o produktoch a zľavách v rámci Slovenska, Malého pohraničného styku a zahraničia, o cestovných poriadkoch a predaji cestovných lístkov cez internet možno získať na adrese www.slovakrail.sk.
Historická budova prvej hlavnej železničnej stanice v Bratislave bola postavená v roku 1871 podľa projektu Ignáca Feiglera v novorenesančnom štýle. Neskôr centrálnu budovu zbúrali, ponechali však dve bočné budovy, ktoré existujú po mnohých adaptáciách až do dnes. Na mieste centrálnej budovy postavili v roku 1905 súčasnú budovu hlavnej železničnej stanice, ku ktorej po roku 1980 pristavili novú vstup. V súčasnosti je naplánovaná rekonštrukcia celého objektu.