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Kurz nach seiner Eröffnung im Mai 1960 gelang es dem Zoo Bratislava Makaken, Paviane, Stachelschweine, Biberrazze, Leoparden, Pumas und sogar Dingos in Gefangenschaft zu züchten und war zudem einer der ersten Zoos in Europa, in dem sich ein Paar des Eurasischen Luchses vermehrte. Der Zoo ist besonders bekannt für die Zucht von Antilopen, Pavianen und Damhirschen; momentan gibt es im Zoo mehr als 1‘000 Tiere und mehr als 140 Tierarten zu sehen.